מושב גבעת יערים שוכן בהרי ירושלים, כתשעה ק"מ מדרום מערב למחלף הראל (כביש תל-אביב ירושלים, בואך ירושלים), ראה מפת טיולים וסימון שבילים מבואות י-ם ("הפרוזדור"), הרי יהודה וצפון השפלה.
ישובים שכנים: מצפון ליישוב- המושבים שואבה ושורש, במזרח- קיבוץ צובה, עין ראפה ועין נקובה, בדרום מערב- המושבים רמת רזיאל וכיסלון.
פסגתו של מושב גבעת יערים הוא בנקודת גובה 723 מטרים מעל פני הים. סביב לגבעה ערוצי נחל עמוקים, מצפון למושב- נחל כיסלון, שמתחיל מצפון מערב למבשרת ציון, מפריד בין גבעת יערים לבין כביש כביש י-ם תל אביב, עובר בגן לאומי הרי יהודה, מגיע עד מושב אשתאול ובסופו של דבר מתחבר ערוץ נחל שורק. בדרום למושב- נחל טייסים, המפריד בין מושב גבעת יערים לבין הר הטייסים ושלוחותיו, ומתחבר לנחל כיסלון ממערב למושב גבעת יערים וגבעת מיש. (נ.ג 623)
אזור המושב גבעת יערים מרהיב ביופיו וטומן בחובו שמורות טבע, גנים לאומיים, ערוצי נחלים, מעייניות, תצפיות מרהיבות, חורש טבעי ויערות נטועים שבהם פינות מרגוע ונופש פעיל.